Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ACTBP60709 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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ACTBP60709 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ACTBP60709 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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