Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3BP58499 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms