Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NUP107P57740 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NUP107P57740 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NUP107P57740 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms