Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
POU3F4P49335 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms