Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSNK1A1P48729 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms