Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSR1P43307 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSR1P43307 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms