Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ETV4P43268 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ETV4P43268 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms