Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHI3L1P36222 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms