Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GJA4P35212 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GJA4P35212 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GJA4P35212 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GJA4P35212 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms