Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
OTX2P32243 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
OTX2P32243 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
OTX2P32243 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms