Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRMP28827 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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