Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DMAP28067 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DMAP28067 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms