Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DNMT1P26358 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DNMT1P26358 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms