Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTAFRP25105 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms