Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPREP23469 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPREP23469 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPREP23469 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPREP23469 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPREP23469 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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