Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RASA1P20936 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RASA1P20936 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
RASA1P20936 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RASA1P20936 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RASA1P20936 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms