Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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HOXA5P20719 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA5P20719 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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