Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PTPRAP18433 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRAP18433 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms