Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRG2P13727 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms