Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA4P13612 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGA4P13612 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms