Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
VPREB1P12018 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms