Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PGA3P0DJD8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms