Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGA5P08648 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGA5P08648 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms