Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms