Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATG7O95352 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATG7O95352 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ATG7O95352 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms