Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LRATO95237 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRATO95237 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRATO95237 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRATO95237 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRATO95237 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRATO95237 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms