Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF254O75437 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms