Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRAMEF10O60809 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRAMEF10O60809 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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PRAMEF10O60809 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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PRAMEF10O60809 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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PRAMEF10O60809 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRAMEF10O60809 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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