Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMPRSS11DO60235 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms