Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNQ3O43525 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNQ3O43525 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms