Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LRRTM2O43300 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
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