Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E2F3O00716 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
E2F3O00716 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
E2F3O00716 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms