Protein–RNA interactions for Protein: O00512

BCL9, B-cell CLL/lymphoma 9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL9O00512 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BCL9O00512 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL9O00512 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL9O00512 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BCL9O00512 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms