Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf172C9J069 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms