Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HACD1B0YJ81 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HACD1B0YJ81 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms