Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SDR42E2A6NKP2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms