Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSDA5PKW4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms