Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LRRD1A4D1F6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms