Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM129A0AVI4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms