Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RHBDD3Q9Y3P4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RHBDD3Q9Y3P4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms