Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM35Q9UPQ4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM35Q9UPQ4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms