Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDRG4Q9ULP0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms