Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MLH3Q9UHC1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms