Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DBF4Q9UBU7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DBF4Q9UBU7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms