Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLKQ9UBT6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
POLKQ9UBT6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms