Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPS6KB2Q9UBS0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms