Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
LMBRD1Q9NUN5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LMBRD1Q9NUN5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms