Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms