Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOMER3Q9NSC5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms