Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KRT82Q9NSB4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KRT82Q9NSB4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms